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k-배율 순위패턴매칭문제를 해결하는 알고리즘

박경빈, 김영호, 나중채, 심정섭

http://doi.org/10.5626/JOK.2022.49.8.585

두 문자열의 길이가 같고 문자열 내에서 같은 위치의 문자들의 상대적 순위가 모두 동일하면 두 문자열은 순위동형이다. 순위패턴매칭문제는 길이가 n인 문자열 T와 길이가 m인 문자열 P가 주어졌을 때, P와 순위동형인 T의 모든 부분문자열을 찾는 문제이다. 순위패턴매칭은 주가지수 분석, 멜로디 분석과 같은 시계열데이터 분석에 활용될 수 있다. 본 논문에서는 순위패턴매칭을 확장한 k-배율 순위패턴매칭문제를 정의하고, 이 문제를 O(n+mlogm) 시간에 해결하는 알고리즘을 제시한다. 또한, O(n+m) 개의 스레드를 사용하여 O(m+k) 시간에 k-배율 순위패턴매칭문제를 해결하는 병렬알고리즘을 제시한다.

Karp-Rabin 알고리즘을 이용한 순위다중패턴매칭 알고리즘의 병렬 구현

박경빈, 김영호, 심정섭

http://doi.org/10.5626/JOK.2021.48.3.249

길이가 같은 두 문자열은 각 문자의 상대적 순위가 모두 일치할 때 순위동형이라 한다. 순위다중패턴매칭문제는 텍스트 T(|T|=n)와 패턴들의 집합 P̃={P₁,P₂,...,Pk}가 주어졌을 때, P̃의 패턴들과 순위동형인 T의 모든 부분문자열을 찾는 문제이다. 패턴들 중 가장 짧은 패턴의 길이를 m, 가장 긴 패턴의 길이를 m̅, 모든 패턴들의 길이의 합을 M이라 하자. M∈mO(1)인 경우 Karp-Rabin 알고리즘을 이용하여 탐색단계를 평균적으로 O(n)시간에 수행하는 순위다중패턴매칭 알고리즘이 제시되었다. 본 논문에서는 Karp-Rabin 알고리즘을 이용하여 순위다중패턴매칭문제를 병렬적으로 해결하는 구현 방법을 제시한다. 제시하는 병렬 구현은 전처리단계를 O(M)개의 스레드를 사용하여 평균적으로 O(m̅)시간에 수행하며, 탐색단계를 O(n)개의 스레드를 사용하여 평균적으로 O(m)시간에 각각 수행한다. 무작위로 생성된 문자열에 대해 실험한 결과, n=1,000,000, k=1,000, m=5 일 때 본 논문에서 제시하는 병렬 구현이 기존의 순차알고리즘보다 약 201.5배 빠르게 수행되었다.


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